MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia phage CPAR39

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002180	CTAC	2	8	557	564	25 %	25 %	0 %	50 %	9791178
2	NC_002180	ATTTG	2	10	612	621	20 %	60 %	20 %	0 %	9791178
3	NC_002180	TGA	2	6	637	642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9791178
4	NC_002180	ACC	2	6	680	685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9791178
5	NC_002180	AAT	2	6	698	703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9791178
6	NC_002180	CTT	2	6	710	715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9791178
7	NC_002180	ACTTC	2	10	738	747	20 %	40 %	0 %	40 %	9791178
8	NC_002180	TAT	2	6	959	964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9791178
9	NC_002180	AAG	2	6	968	973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9791178
10	NC_002180	GA	4	8	1085	1092	50 %	0 %	50 %	0 %	9791178
11	NC_002180	ATT	2	6	1121	1126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9791178
12	NC_002180	TTC	2	6	1189	1194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9791178
13	NC_002180	TGC	2	6	1264	1269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9791178
14	NC_002180	GAA	2	6	1398	1403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9791178
15	NC_002180	TGT	3	9	1513	1521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9791178
16	NC_002180	GA	3	6	1547	1552	50 %	0 %	50 %	0 %	9791178
17	NC_002180	CAG	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9791178
18	NC_002180	GAA	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9791178
19	NC_002180	TCC	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9791178
20	NC_002180	GTT	2	6	1706	1711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9791178
21	NC_002180	TGGT	2	8	1744	1751	0 %	50 %	50 %	0 %	9791178
22	NC_002180	AAC	2	6	1932	1937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9791177
23	NC_002180	CAG	2	6	1956	1961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9791177
24	NC_002180	TCCT	2	8	1985	1992	0 %	50 %	0 %	50 %	9791177
25	NC_002180	AG	3	6	2066	2071	50 %	0 %	50 %	0 %	9791177
26	NC_002180	GAA	2	6	2131	2136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9791177
27	NC_002180	CTT	2	6	2178	2183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9791177
28	NC_002180	AAT	2	6	2210	2215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9791177
29	NC_002180	AG	3	6	2221	2226	50 %	0 %	50 %	0 %	9791177
30	NC_002180	ACTT	2	8	2257	2264	25 %	50 %	0 %	25 %	9791177
31	NC_002180	GCAG	2	8	2281	2288	25 %	0 %	50 %	25 %	9791177
32	NC_002180	AT	3	6	2368	2373	50 %	50 %	0 %	0 %	9791177
33	NC_002180	TAGA	2	8	2409	2416	50 %	25 %	25 %	0 %	9791177
34	NC_002180	TCT	2	6	2425	2430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9791177
35	NC_002180	T	6	6	2460	2465	0 %	100 %	0 %	0 %	9791177
36	NC_002180	AAGG	2	8	2472	2479	50 %	0 %	50 %	0 %	9791177
37	NC_002180	A	8	8	2505	2512	100 %	0 %	0 %	0 %	9791182
38	NC_002180	CAA	2	6	2549	2554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9791182
39	NC_002180	CAA	2	6	2557	2562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9791182
40	NC_002180	AAC	2	6	2579	2584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9791182
41	NC_002180	CGA	2	6	2630	2635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9791182
42	NC_002180	CGT	2	6	2689	2694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9791182
43	NC_002180	GAA	2	6	2789	2794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9791182
44	NC_002180	GAA	2	6	2801	2806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9791182
45	NC_002180	T	6	6	2861	2866	0 %	100 %	0 %	0 %	9791182
46	NC_002180	GAT	2	6	2882	2887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9791182
47	NC_002180	A	6	6	2943	2948	100 %	0 %	0 %	0 %	9791181
48	NC_002180	A	6	6	2955	2960	100 %	0 %	0 %	0 %	9791181
49	NC_002180	A	7	7	2966	2972	100 %	0 %	0 %	0 %	9791181
50	NC_002180	A	6	6	2978	2983	100 %	0 %	0 %	0 %	9791181
51	NC_002180	GA	3	6	3009	3014	50 %	0 %	50 %	0 %	9791181
52	NC_002180	A	6	6	3086	3091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002180	GAA	2	6	3146	3151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9791180
54	NC_002180	T	6	6	3185	3190	0 %	100 %	0 %	0 %	9791180
55	NC_002180	GAA	2	6	3230	3235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002180	GGC	2	6	3244	3249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_002180	ACA	2	6	3362	3367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_002180	TGT	2	6	3418	3423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9791179
59	NC_002180	TTTAA	2	10	3427	3436	40 %	60 %	0 %	0 %	9791179
60	NC_002180	GT	3	6	3453	3458	0 %	50 %	50 %	0 %	9791179
61	NC_002180	AAG	2	6	3514	3519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9791179
62	NC_002180	TGCA	2	8	3664	3671	25 %	25 %	25 %	25 %	9791179
63	NC_002180	T	6	6	3699	3704	0 %	100 %	0 %	0 %	9791179
64	NC_002180	ATC	2	6	3758	3763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9791179
65	NC_002180	GTTT	2	8	3767	3774	0 %	75 %	25 %	0 %	9791179
66	NC_002180	ATC	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9791179
67	NC_002180	TTAT	2	8	3872	3879	25 %	75 %	0 %	0 %	9791179
68	NC_002180	AAG	2	6	3898	3903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9791179
69	NC_002180	CT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	0 %	50 %	9791179
70	NC_002180	GAA	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9791179
71	NC_002180	TTG	2	6	4169	4174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9791179
72	NC_002180	TCC	2	6	4206	4211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9791179
73	NC_002180	CAAA	2	8	4266	4273	75 %	0 %	0 %	25 %	9791179
74	NC_002180	AT	3	6	4335	4340	50 %	50 %	0 %	0 %	9791179
75	NC_002180	GAG	3	9	4378	4386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9791179
76	NC_002180	T	6	6	4398	4403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002180	A	6	6	4404	4409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002180	T	6	6	4417	4422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002180	CAG	2	6	4467	4472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_002180	CTTT	2	8	4474	4481	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.